La Red de Sobrevivientes de Abuso por Sacerdotes (SNAP) acusó al papa León XIV de encubrir casos de abuso sexual mientras fue obispo en Chiclayo, Perú. Según la organización, en 2000, el entonces obispo Robert Francis Prevost permitió que el sacerdote James Ray, acusado de abusar de al menos 13 menores, viviera en un convento de Chicago, a pesar de las restricciones impuestas a Ray. SNAP señaló que Prevost, quien también fue superior de los agustinos, fue consciente de los abusos y no actuó adecuadamente.

En 2022, tres mujeres denunciaron públicamente los abusos, alegando que Prevost no investigó, no informó adecuadamente a Roma y permitió que el sacerdote siguiera celebrando misa. Aunque los fiscales cerraron el caso en 2023, el sucesor de Prevost en Chiclayo reabrió la investigación tras una queja pública.

SNAP presentó una queja formal contra Prevost ante el Vaticano en 2025, pidiendo medidas de transparencia, la creación de un fondo de reparaciones para víctimas y la implementación de leyes de cero tolerancia en la Iglesia. A pesar de sus demandas, la organización no ha recibido respuesta del Vaticano. Además, SNAP pidió al papa León XIV que se disculpe y delegue las investigaciones a personas ajenas al Vaticano para asegurar la credibilidad de las investigaciones.

En 2019, mientras era obispo, Prevost se manifestó públicamente contra el encubrimiento de los abusos y llamó a la comunidad a denunciar los casos de abuso sexual. Algunos expertos, como el sociólogo Rodolfo Soriano, han destacado los esfuerzos de Prevost en abordar este tema en Perú.